據中央社引述四川電台報道，地震震央汶川縣東南部的綿竹縣清平鎮，一些小孩臉上陸續出現紅疹，必須藥物治療。報道又呼籲各方向清平捐贈消毒藥物。紅十字會呼籲災民盡快離開災區，擔心兩日內有大型疫症爆發。

在北川，生還者及死屍不斷被抬出，有現場人士聲稱災區環境惡劣，大量屍體隨處放、便溺處處。另外，屍體在陽光照射下快要腐爛。

香港傳染病專家勞永樂表示，災民出現紅疹或是麻疹的症狀，又指由於內地對麻疹的防疫注射不太重視，加上災民所處環境擠迫，假如有一人患病，即有機會迅速傳播。他又指出，麻疹可引起併發症如腦炎、肺炎等，後果嚴重，若當局確定有疫情出現，必須盡快運送疫苗到當地。

由於衛生欠佳，救援人員必須戴口罩，灑消毒劑，有內地消防隊亦表示相信很快會有疫症爆發，呼籲民眾盡快撤離災區，他們亦會評估衛生環境，再決定會否撤走。

據《廣州日報》報道，有醫務人員指由於氣溫升高，部分傷者的傷口有感染危機，加上在部分嚴重災區，屍體得不到及時處理，高溫會令細菌加快繁殖，增加防疫壓力。